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2021/08/28  阅读:36  主题:自定义主题1

递归思想处理半结构化数据

利用递归思想处理半结构化数据

1. 背景

在日常数据分析的工作中,我们收集到的原始数据有时并不是整齐的表格形式,例如在爬取网页或者爬取api里的数据时,结果往往是以XML或者JSOM(类似Python中的字典)格式返回,并且层层嵌套。就像如下这样的JSON格式:

[{
    'state''Florida',
    'shortname''FL',
    'info': {
        'governor''Rick Scott'
    },
    'counties': [
        {'name''Dade''population': 12345},
        {'name''Broward''population': 40000},
        {'name''Palm Beach''population': 60000}
    ]},
    {
    'state''Ohio',
    'shortname''OH',
    'info': {
        'governor''John Kasich'
    },
    'counties': [
        {'name''Summit''population': 1234},
        {'name''Cuyahoga''population': 1337}]
    }]

这种嵌套形式的数据如果很复杂,确实不适合人类阅读,如果要对数据进行进一步地清洗或者分析,我们要做的第一步是把嵌套"打开",转化成类似如下形式的表格:

name population state shortname info.governor
Dade 12345 Florida FL Rick Scott
Broward 40000 Florida FL Rick Scott
Palm Beach 60000 Florida FL Rick Scott
Summit 1234 Ohio OH John Kasich
Cuyahoga 1337 Ohio OH John Kasich

我们希望表格内每一条记录是county-level,和可是怎么转化呢?试试万能的pandas吧:

# 尝试直接转化为DataFrame
df = pd.DataFrame(data)
print(df)

输出为:

name shortname info counties name"
Florida FL {'governor': 'Rick Scott'} [{'name': 'Dade', 'population': 12345}, {'name... NaN
NaN OH {'governor': 'John Kasich'} [{'name': 'Summit', 'population': 1234}, {'nam... Ohio

发现pandas只解析了第一层state-level的记录,而county-level的数据还是以嵌套的形式展现。经过亿点点查找,发现pandas自带一个叫做json_normalize的函数可以实现我们的需求:

# 使用json_normalize():
pd.json_normalize(
    data, 
    record_path = 'counties',  # 定义数据粒度
    meta = ['state''shortname',['info''governor']] # 定义存入结果表的列名
    )

输出为:

name population state shortname info.governor
Dade 12345 Florida FL Rick Scott
Broward 40000 Florida FL Rick Scott
Palm Beach 60000 Florida FL Rick Scott
Summit 1234 Ohio OH John Kasich
Cuyahoga 1337 Ohio OH John Kasich

这和我们预期的结果一样。但是这一过程是如何实现的呢?其实,这是递归思想的在实际应用的范例之一。

2. 什么是递归?

想要知道什么是递归?先了解什么是递归。

没错,递归的本质就是"复读",在计算机编程中,递归就是通过函数调用自身,把问题转化成解决一个过程相似,但是规模较小的问题,直到到达边界条件即小化的问题。一个完整的递归函数一般具有以下三要素:

  • 终止条件
  • 函数运行状态,每次运行都逐步逼近终止条件
  • 调用函数自身

以通过递归算法求解斐波那契数列为例:

def Fibonacci(n):
    def _recurse(n):
        if n == 0# 边界条件
            return 0
        elif n == 1# 边界条件
            return 1
        else:
            return _recurse(n-1) + _recurse(n-2# 调用自身,缩小问题规模
    return _recurse(n)

想要求第n个斐波那契数f(n),我们只需要计算f(n-1)和f(n-2)的值,这一步相当于把问题规模缩小。这个问题可以递推到计算f(2)=f(1)+f(0)。又因为f(1)和f(0)的值是我们已知的边界条件,我们便可以推导出f(2)值,由此逐步得出f(n)。

类似地,在解析嵌套的JSON数据时,我们可以设计一个函数f()解析当前层的字典,当字典中的某个值(value)为的type为字典或者字典列表时,调用同样的函数f(n),直到满足value中不含字典这一边界条件。同时,我们需要记录解析遍历的键值对,字典的键即为输出表格中的字段,字典的值为表格中的record。

我们来看下pandas v1.2.0 源码中_json_normalize()的核心代码:


def _json_normalize(
    data: Union[Dict, List[Dict]],
    record_path: Optional[Union[str, List]] = None,
    meta: Optional[Union[str, List[Union[str, List[str]]]]] = None,
    meta_prefix: Optional[str] = None,
    record_prefix: Optional[str] = None,
    errors: str = "raise",
    sep: str = ".",
    max_level: Optional[int] = None,
)
 
    # 定义一些辅助函数
    def _pull_field(js: Dict[str, Any], spec: Union[List, str])
        """Internal function to pull field"""
        # 省略具体实现代码
        ...
        return result
        
    def _pull_records(js: Dict[str, Any], spec: Union[List, str]) -> List:

        """
        Internal function to pull field for records, and similar to
        _pull_field, but require to return list.
        """

        # 省略具体实现代码
        ...
        return result  
       
    # 省略一些对输入参数的处理和判定的代码   
    
    # 定义一些函数内变量
    _meta = [m if isinstance(m, list) else [m] for m in meta] # 需要展现在结果里的字段
    records: List = []
    lengths = []
    # meta_val用于存储fields对应的数值
    meta_vals: DefaultDict = defaultdict(list)
    # 在深层字典里的字段,用上一层的字段名+分隔符+这一层的字段名代替,防止字段重复,如例子中的 ['info', 'governor'] 处理成 info.governor
    meta_keys = [sep.join(val) for val in _meta]
    
    # 核心代码:
    # Disastrously inefficient for now
    def _recursive_extract(data, path, seen_meta, level=0):
        if isinstance(data, dict):
            data = [data]

        if len(path) > 1#这里对于多个record_path的情况进行递归
            for obj in data:
                for val, key in zip(_meta, meta_keys):
                    if level + 1 == len(val):
                        seen_meta[key] = _pull_field(obj, val[-1])

                _recursive_extract(obj[path[0]], path[1:], seen_meta, level=level + 1)

        else:
            # 遍历当前层的data
            for obj in data:
                # 取出当前层所有的records (list of dict)
                recs = _pull_records(obj, path[0])
                # pandas 中的另一个内置函数,如果records里面有dict,将dict打开。
                # 例如如果有一条记录是{'a':{'b':1}} 则会变成 {'a.b':1}
                recs = [
                    nested_to_record(r, sep=sep, max_level=max_level)
                    if isinstance(r, dict)
                    else r
                    for r in recs
                ]

                # For repeating the metadata later
                lengths.append(len(recs)) # 记录当前层级records的数量
                for val, key in zip(_meta, meta_keys):
                    if level + 1 > len(val): # 如果字段在下一层dict,如val为['info', 'governor'],则取seen_meta['info.governer']
                        meta_val = seen_meta[key]
                    else# 取出当前层字段对应的value
                        try:
                            meta_val = _pull_field(obj, val[level:])
                        except KeyError as e:
                            if errors == "ignore":
                                meta_val = np.nan
                            else:
                                raise KeyError(
                                    "Try running with errors='ignore' as key "
                                    f"{e} is not always present"
                                ) from e
                    meta_vals[key].append(meta_val)
                records.extend(recs) 

    _recursive_extract(data, record_path, {}, level=0)
    
    # 省略一些对result的格式后处理代码
    
    return result

可以看出源码还是稍微有些难以理解的,此外代码作者也吐槽目前的执行效率很低,但这个函数好在可以通过定义record_path控制解析的深度,防止将过深的半结构化数据完全展开,产生过多的记录。

3. 总结

虽然数据分析师的日常工作中往往不需要直接接触算法,但掌握一些算法思想往往可以帮助我们更好地理解手边的工具。必要时也可以自己编写代码提高效率。除了刷算法题之外,读读优秀开源项目地源码也是很好的提升方式。如果实在没有时间,那就常来我们的公众号上看看吧!

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